MicroRNAs相关单核苷酸多态性与食管癌遗传易感性研究

食管癌是常见的恶性肿瘤之一，我国是食管癌发病率和死亡率最高的国家，每年新发病例约25万，占全世界新发病例数的一半。食管癌的发病非常复杂，但普遍认为是环境、遗传等多种因素综合作用的结果。MicroRNAs（miRNAs）是一类长为20-24个核苷酸的内源性非编码的单链小分子RNA，miRNAs以碱基互补配对方式结合到靶基因mRNA的3’非翻译区(3'UTR)的miRNAs结合位点(MREs)，导致mRNA降解或抑制其翻译，从而实现转录后水平的靶基因的调控。MiRNAs的表达失调与肿瘤的发生密切相关。随着近年来对miRNAs研究的深入，发现miRNAs相关的SNPs在肿瘤中也发挥着重要作用。MiRNAs相关SNPs主要包括三部分，即miRNAs基因自身SNPs，miRNAs合成通路相关基因SNPs以及miRNAs靶序列SNPs。MiRNAs相关的SNPs可影响成熟miRNAs的表达、结构以及其与靶基因的结合等，使miRNAs调控发生异常，从而参与肿瘤的发生、发展过程。本研究选取miRNAs相关的5个位点，探讨miRNAs相关SNPs与食管癌遗传易感性的关系，这将为食管癌的病因学研究提供新的方向，同时为食管癌的预防、监测、早期筛查、预后判断以及个体化治疗提供理论依据。
　　 目的:
　　 本研究通过选取miRNAs相关的5个位点，分别是miRNAs基因自身的miRNA146ars2910164和miRNA196a-2rs11614913位点，合成通路基因GEMIN4rs7813位点，以及靶序列基因ErbB4rs1595066和rs16845990位点，探讨miRNAs相关SNPs与食管癌遗传易感性的关系。同时结合环境因素评价基因-基因/基因-环境交互作用在食管癌发生中的作用。为食管癌的预防、监测、早期筛查、预后判断以及个体化治疗提供理论依据。
　　 方法:
　　 运用分子流行病学的方法，结合病例-对照研究，在河南汉族人群中，按性别和年龄进行频数匹配，选择381例来自医院的原发性食管癌病例和426例来自人群的健康对照，收集其相关资料，采集血样，采用全血基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA，分别采用PCR-RFLP和AS-PCR技术对上述5个位点进行基因型检测。用统计软件SPSS12.0对样本的人群特征进行频数统计;采用x2检验比较病例组和对照组之间年龄、性别、吸烟、饮酒、肿瘤家族史以及基因型频数的分布差异;比值比(Oddratio，OR)及其95％可信区间(95％CI)估计关联强度，非条件logistic回归模型计算调整性别、年龄、吸烟、饮酒和肿瘤家族史后的OR及其95％CI。利用Hardy-weinberg平衡在线分析软件(http://ihg2.helmholtz-muenchen.de/cgi-bin/hw/hwal.pl)判断对照组的Hardy-Weinberg。利用Haploview4.2软件计算ErbB4基因2个位点间的连锁不平衡(linkerddimorphisms，LD)值。并利用SHEsis在线软件(http://analysis.bio-x.cn/myAnalysis.php)进行单体型预测、构建及分析。利用x2检验比较单体型在病例组和对照组间的分布差异。MDR2.0软件分析基因-环境的交互作用。
　　 结果:
　　 单位点分析结果显示，miR-196a-2基因rs11614913TT基因型携带者食管癌发病风险比CC基因型携带者降低38％(OR:0.62，95％CI:0.39-0.99)。与GG基因型携带者相比，ErbB4基因rs1595066位点AA基因型携带者食管癌发病风险降低62％(OR:0.38，95％CI:0.24-0.61)，基因型(GA+AA)的个体患食管癌的风险则降低38％(OR:0.62，95％CI:0.45-0.85);A等位基因携带者食管癌的发病风险比G等位基因携带者降低36％(OR:0.64，95％CI:0.52-0.78)。ErbB4基因单体型AC和AT可以降低食管癌的发病风险，其OR(95％CI)分别为0.75(0.60-0.94)和0.65(0.49-0.86);而单体GC和GT能增加食管癌的发病风险，其OR(95％CI)分别为1.46(1.08-1.99)和1.33(1.10-1.62)。MDR分析基因-环境交互作用显示，最优模型是肿瘤家族史与吸烟交互作用模型，该模型表明，具有肿瘤家族史且吸烟的“高危”人群的食管癌发病风险是非上述组合的“低危”人群的3.66倍。
　　 结论:
　　 MiR-196a-2基因rS11614913TT基因型和ErbB4基因rs1595066A等位基因能够降低食管癌的发病风险，其余3个位点(rs2910164、rs7813和rs16845990)的多态性可能与食管癌的易感性无关。ErbB4基因单体型AC和AT是食管癌的保护性因素;单体型GC和GT是食管癌的危险因素。肿瘤家族史和吸烟在食管癌的发生中具有交互作用。