新疆哈萨克族和汉族食管癌环境遗传因素及其交互作用的研究

目的：通过病例-对照研究探讨哈萨克族、汉族食管癌发生的环境危险因素，其次通过多种高通量的SNP检测技术识别与哈萨克族食管癌关系密切的基因多态位点。再利用生物信息学技术，研究基因－基因、基因－环境交互作用在食管癌发生中的作用，以阐明食管癌易感性差异机制，为食管癌的综合防治提供科学依据。
　　 方法：通过成组的病例对照研究方法收集哈萨克族（以下简称哈族）食管癌患者132例，汉族107例。对照选择非食管癌患者，其中哈族309例，汉族204例。研究对象进行了包括膳食、吸烟、饮酒、饮茶等环境因素与食管癌关系的流行病学调查。并采集每位研究对象外周静脉血5ml，提取DNA，利用Hapmap数据库选择CYP1A1、CYP2A6、GSTM1、MTHFR、hOGG1和hCHK2六个候选基因18个功能和标签SNP位点，采用PCR-LDR技术进行检测，分析基因型，进行全部样本SNP位点的基因型鉴定工作，建立数据库，采用单因素分析哈族和汉族食管癌发病与各基因位点的多态性是否存在相关关系；利用SHEsis软件分析各多态位点间的连锁不平衡状态，并对tagSNPs进行单体型构建和统计学分析。将与食管癌发生有关的环境及遗传因素结合起来，在多因素的人群归因度模型中，计算其调整人群归因危险度（PARc%）及多因素综合人群归因危险度（sPAR%），并进行环境-基因交互作用的分析。
　　 结果：1）哈族人群中食管癌环境危险因素的相对危险度（OR）由高到低依次为：饮用河水（7.24）、饮酒（6.38）、喜饮烫茶（5.70）、多饮奶茶（5.62）、饮用井水（3.76）、进食速度快（3.52）、喜食烫饭（3.31）、常吃熏肉（2.83）、家族史（2.70）、吸烟（2.68）、常吃酸奶疙瘩（2.62）、常喝酸奶（0.31）、蔬菜摄入量（0.30）、文化程度（0.28）、牛（羊、马）奶摄入≤400ml/日（0.23），环境危险因素的调整人群归因危险度（PARc%）由高到低依次为：饮用烫茶71.84%、多饮奶茶69.13%、经济收入≤500元/月67.93%、喜食烫饭60.80%、蔬菜摄入量少60.58%、饮用河水56.81%、文化程度低56.17%、牛（羊、马）奶摄入≤400ml/日54.95%、进食速度快54.78%、饮用井水52.83%、常吃熏肉46.54%、常吃酸奶疙瘩39.82%、少喝酸奶36.81%、饮酒33.22%和吸烟28.49%，这16项环境因素的综合人群归因危险度为91.36%，在汉族人群中食管癌环境危险因素的相对危险度（OR）由高到低依次为：常吃熏肉（9.73）、常吃酸菜（7.19）、喜食烫饭（3.13）、水果摄入少（0.25）、经济收入低（0.24）、少喝酸奶（0.11），环境危险因素的调整人群归因危险度（PARc%）由高到低依次为：少喝酸奶85.36%、常吃熏肉60.37%、经济收入低54.87%、水果摄入少53.66%、常吃酸菜43.45%和喜食烫饭41.36%，这6项环境因素的综合人群归因危险度为86.53%；2）在哈族人群中，携带GSTM1基因缺失型个体发生食管癌的危险性是非缺失型个体的1.56倍；MTHFR基因rs13306561位点等位基因及基因型（TC与CC基因型合并）分布在病例组和对照组分布均有显著性差异，即携带C等位基因者发生食管癌的风险增加（OR=1.67），其余基因不同位点的等位基因及基因型与哈族食管癌的关系在本研究中未发现有关联。在汉族人群中，CYP1A1基因rs1048943位点携带G变异个体者发生食管癌的风险增高（OR=1.79）；MTHFR基因rs9651118位点携带C等位基因者发生食管癌的风险降低（OR=0.59），MTHFR基因rs1801133位点携带CT基因型和TT基因型者分别可增加发生食管癌危险性的2.21倍和3.45倍；hOGG1基因rs1801126位点GT基因型可使食管癌发生的危险性增加（OR=10.05），其余基因不同位点的等位基因及基因型与汉族食管癌之间未发现有关联；3）通过对MTHFR基因的7个多态位点进行两两连锁不平衡分析，结果表明哈族只有A-A-C-T-T-T-T型在两组中频率分布差异有统计学意义，而汉族只有C-C型和C-T型在两组中频率分布差异有统计学意义。哈族人群在GSTM1基因缺失型与吸烟交互作用模型中：基因缺失型的Org为1.87，吸烟的Ore为7.70，交互作用Oreg为9.23，符合次相乘模型。GSTM1基因与饮酒、饮用河水、饮用井水和食用酸奶疙瘩的Oreg分别为35.08、10.47、2.73、8.09，均符合超相乘模型；汉族人群GSTM1基因与饮用井水、食用熏肉、食用酸菜的交互作用Oreg分别为11.17、32.51、18.37，均符合超相乘模型；MTHFR rs1801133与水果摄入量的交互作用Oreg为8，符合次相乘模型。
　　 结论：1）新疆地区哈萨克族人群食管癌发生与饮用烫茶、多饮奶茶、经济收入≤500元/月、喜食烫饭、蔬菜摄入量少、饮用河水、文化程度低、牛（羊、马）奶摄入≤400ml/日、进食速度快、饮用井水、常吃熏肉、常吃酸奶疙瘩、少喝酸奶、饮酒和吸烟这16项环境因素密切相关；在汉族人群食管癌发生与少喝酸奶、常吃熏肉、经济收入低、水果摄入少、常吃酸菜和喜食烫饭这6项环境因素密切相关；2）SNP位点基因型分析发现哈族与汉族食管癌人群中基因分布有差异。在哈族人群中，GSTM1基因缺失型和MTHFR rs13306561位点多态性与食管癌易感性有关；在汉族人群中，CYP1A1 rs1048943位点多态性、GSTM1基因缺失型、MTHFR rs1801133和rs9651118位点多态性、hOGG1rs1801126位点多态性与食管癌易感性有关，其中携带MTHFRrs9651118位等位基因C者发生食管癌的风险性降低。基因-基因之间的联合作用的分析结果表明，携带易感性等位基因越多，发生食管癌的危险性越大；3）环境-基因交互作用分析显示哈族GSTM1基因与饮酒、饮用河水、饮用井水和食用酸奶疙瘩呈现较强的交互作用，GSTM1基因缺失型与吸烟呈现一定的交互作用；汉族GSTM1与饮用井水、食用熏肉、食用酸菜呈现较强的交互作用，MTHFR rs1801133位点与水果摄入不足有一定的交互作用。